O Agrupamento de Escolas Cidade do Entroncamento foi constituído a 3 de julho de 2012. Nos termos da regulamentação legal, em maio de 2022, foi assinado um contrato interadministrativo de transferência de competências relativas a pessoal não docente e sobre o edificado da escola sede, que passaram a ser da responsabilidade do município.
O Agrupamento está inserido na cidade do Entroncamento, que integra o concelho do mesmo nome, do distrito de Santarém, com apenas 13,7km2 e com 20 141 habitantes (Censos, 2021,
www.pordata.pt). Serve a população das duas freguesias que o constituem, Nossa Senhora de Fátima e S. João Baptista.
Apesar de ser o concelho mais pequeno da região, e o segundo mais pequeno a nível nacional, tem uma grande densidade populacional (1466,9h/Km2), comparativamente com a Comunidade Intermunicipal do Médio Tejo (CIMT) de que faz parte, com o distrito e com a grande maioria dos concelhos do país.